盖伦将希波克拉底的医学理论一直传递到文艺复兴。他的《希波克拉底的元素》描写了基于四元素说上的四气说的哲学系统。从这个理论上他发展了自己的理论。他对瑟尔苏的用拉丁语写的反对的理论基本上一字不提。

         盖伦最主要的著作是他的17卷的“人体各部位的作用”。此外他还写了关于哲学和语言学的著作。他的著作一共有22卷。

         盖伦的理论与柏拉图的一致，他认为世界是由一个造世者故意建造的——这是为什么他的著作后来这样容易被基督教徒和穆斯林接受。他最基本的理论是生命来自于“气”，后来的作家将盖伦的气与[[灵魂相结合。脑中的“动气”（Pneuma physicon）决定运动、感知和感觉。心的“活气”（Pneuma zoticon）控制体内的血液和体温。肝的气控制营养和新陈代谢。

        盖伦的许多知识来自于他对活体动物的解剖。他的一个方式是公开地解剖活猪。他切断猪的神经来显示它们的作用，最后他切断喉神经（今天也称为盖伦神经）猪就不叫了。他系住活动物的输尿管来显示尿来自于肾，他破坏脊椎来显示瘫痪的原因。

        从今天的角度来看，盖伦的理论部分是对的，部分是错的。他证明动脉是送血的，而不是送空气的，此外他首次研究了神经的作用以及脑和心的作用。他还认为思考是脑的作用，而不是象亚里斯多德所说的那样是心的作用。

        但从今天的角度出发盖伦的其它许多观点是错的。他没有认识到血液循环而认为静脉系统与动脉系统是无关的。这个观点一直到17世纪才被威廉·哈维纠正。由于他的大多数解剖知识是从解剖猪、狗和猴得来的，他错误地以为人也有迷网，一个在食草动物中常见的血管节。他还反对使用止血带来停止出血的疗法而坚持使用放血疗法。

        直到16世纪盖伦在欧洲是一个医学权威。学者不对实物进行观察而相信盖伦已经描述了一切可以描述的事物。放血疗法成为一个基本疗法。第一个严肃地改变这个状况的是维萨里。